JR 홋카이도는 일본 홋카이도에서 철도 서비스를 운영하는 회사다. 1987년 일본 국유철도가 민영화되면서 설립되었으며, JR 그룹의 6개 여객철도 회사 중 하나다. 본사는 삿포로시에 위치해 있다.

JR 홋카이도는 홋카이도 전역에 걸쳐 철도망을 운영하며, 주요 노선으로는 홋카이도 신칸센, 하코다테 본선, 네무로 본선 등이 있다. 또한 도시간 특급열차와 지역 열차 서비스를 제공한다.

회사는 철도 운영 외에도 버스 서비스, 여행 사업, 부동산 개발 등 다양한 사업을 전개하고 있다. 특히 관광 분야에서는 홋카이도의 자연과 문화를 체험할 수 있는 다양한 관광 열차를 운행하고 있다.

JR 홋카이도는 홋카이도의 광활한 지역과 인구 밀도가 낮은 특성으로 인해 다른 JR 회사들에 비해 경영상의 어려움을 겪고 있으며, 일본 정부와 JR 그룹으로부터 재정 지원을 받고 있다.